Einigen Historikern zufolge war der Hafen bereits in der Römerzeit ein Lagerhaus. Im Mittelalter förderten die Mönche, die den Wald von Cruie (Marly) rodeten, die Entwicklung des Ortes und damit auch des Hafens, der in einer Seine-Schleife ideal geschützt lag. In einer Zeit, in der der Fluss das sicherste Kommunikationsmittel war, bot er der Stadt einen idealen Zugang. Eine notarielle Urkunde belegt die Existenz eines Hafens mit dem Namen "Port de la Loge" oder "Port de Marly". Jahrhundert, als der jüngere Zweig der Montmorency über das obere Marly herrschte, besaßen die Herren von Prunay als ihre Vasallen das Herrenhaus und den Bauernhof, die sich auf dem Gebiet des Hafens und von Louveciennes befanden. Die mit Weinreben bedeckten Hänge von Marly erzeugten einen Clairet, der für würdig befunden wurde, die königliche Tafel zu tränken. Die Fässer wurden über den Hafen nach Paris, in die Normandie und nach England abtransportiert. 1572 erhielt Jacques Nicolas, ein Pariser Bürger, einen Hafen und eine Passage mit dem Namen "Port de la Loge" als Vermächtnis, wo er eine Fähre einrichtete. Im 17. Jahrhundert genoss Ludwig XIV., der Saint-Germain für die Pracht von Versailles verlassen hatte, einige Entspannung in seiner Residenz in Marly. Für die Bedürfnisse des Hofes räumte er dem Hafen von Marly per Patentbrief den Vorrang vor dem Hafen von Aupec (Le Pecq) ein. Im 18. Jahrhundert hatte sich der Warenverkehr des Hafens so stark entwickelt, dass er die Anwesenheit eines königlichen Notars erforderte. Der Hafen zählte zu dieser Zeit eine arbeitende Bevölkerung von 165 Feuern (700 Einwohner), die alle mit den Aktivitäten auf dem Fluss oder dem Betrieb der Kalköfen beschäftigt waren. Im letzten Viertel des Jahrhunderts erlebte das Dorf seinen tiefgreifendsten Wandel. Im Jahr 1778 stattete Ludwig XVI. es mit einer Kapelle aus, die bald darauf zum Pfarrhaus und zur Pfarrei Saint-Louis (1785) erhoben wurde. Auf diese Pfarrei stützten sich die Einwohner, als sie ihre Loslösung von Marly beantragten und ihre eigene Gemeinde wählten. Le Port-Marly wurde im Februar 1790 zu einer unabhängigen Gemeinde. Nach der Revolutionszeit zählte die Bevölkerung nur noch 500 Einwohner, der Handel ging zugrunde, die Kirche war ruiniert und die Schule von Ludwig XVI. geschlossen. Jahrhundert baute es wieder auf: 1806 wurde das Schloss (das ehemalige Herrenhaus der Herren von Prunay) wieder aufgebaut; 1819 betrug die Fläche 144 Hektar; 1846 ließ der Romanautor Alexandre Dumas das Schloss Monte Christo auf dem Hügel von Montferrands errichten. Schließlich kam es 1850 zu einer großen Bevölkerungs-, Handels- und Industrieexplosion, weil sich das Dorf den von der Landflucht betroffenen Provinzbewohnern öffnete, weil alle Aktivitäten am Seineufer stattfanden und weil es Industriebetriebe, Steinbrüche und andere Stollen zum Abbau von Kreide gab. 1853 ließ sich die Familie Rodrigue-Henriquès im Château des Lions nieder, wo sie den Maler Camille Corot empfing, dessen berühmte, zwanzig Jahre später entstandene Bilder den Ruhm von Port-Marly noch ein wenig mehr steigern sollten. Die wechselnden Farben des Flusses inspirierten auch Alfred Sisley, Camille Pissarro und Albert Lebourg. Noch heute beherbergen der Treidelpfad entlang der Seine und seine Kähne mehrere Künstler. Die erste Hälfte des 20. Jahrhunderts brachte den Niedergang der Stadt mit sich: 1914 wurde sie durch den Ersten Weltkrieg entvölkert und 1940 stellte der Hafen seine Handelsaktivitäten ein. Erst 1950 kam es zu einer erneuten Bevölkerungsexplosion, einer fortschreitenden Urbanisierung und einem starken Verkehrsaufkommen (mit der N13).
